Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm28038F7BCN9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms