Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Defa35E9QLQ1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa35E9QLQ1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms