Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Urb2E9Q7L1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Urb2E9Q7L1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms