Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20518E9Q548 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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