Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3M9

2010300C02Rik, RIKEN cDNA 2010300C02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010300C02RikE9Q3M9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2010300C02RikE9Q3M9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms