Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
2610021A01RikE9Q0Q3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
2610021A01RikE9Q0Q3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms