Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt78E9Q0F0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt78E9Q0F0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms