Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx60E9PZQ1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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