Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rsph10bE9PYQ0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rsph10bE9PYQ0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms