Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc17E9PVB5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc17E9PVB5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms