Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms