Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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