Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc6D3YZP9 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms