Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6685D3YYP3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6685D3YYP3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms