Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rfx8D3YU81 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rfx8D3YU81 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rfx8D3YU81 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rfx8D3YU81 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rfx8D3YU81 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rfx8D3YU81 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rfx8D3YU81 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rfx8D3YU81 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rfx8D3YU81 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rfx8D3YU81 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rfx8D3YU81 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rfx8D3YU81 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms