Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm17333C6EQI3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm17333C6EQI3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm17333C6EQI3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm17333C6EQI3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm17333C6EQI3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Gm17333C6EQI3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Gm17333C6EQI3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Gm17333C6EQI3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Gm17333C6EQI3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Gm17333C6EQI3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm17333C6EQI3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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