Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ppfia4B8QI36 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms