Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Abcc8B2RUS7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms