Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Usf3B2RUQ2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usf3B2RUQ2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usf3B2RUQ2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usf3B2RUQ2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Usf3B2RUQ2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Usf3B2RUQ2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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