Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms