Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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