Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Apol7aB2RT54 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms