Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Brpf1B2RRD7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms