Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uhrf1bp1B2KF50 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms