Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
1700042G07RikB1AUF7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms