Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Spocd1B1ASB6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spocd1B1ASB6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms