Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Grik3B1AS29 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms