Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M5A7VMS3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms