Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gbp4A4UUI3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gbp4A4UUI3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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