Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Odf2A3KGV1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms