Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2al1jA2BFR3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms