Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn3aA2ASI5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms