Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Frmpd1A2AKB4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Frmpd1A2AKB4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms