Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Prdm12A2AJ77 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm12A2AJ77 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms