Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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PtprfA2A8L5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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PtprfA2A8L5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
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PtprfA2A8L5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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PtprfA2A8L5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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PtprfA2A8L5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PtprfA2A8L5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PtprfA2A8L5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PtprfA2A8L5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PtprfA2A8L5 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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