Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm27029A2A4P4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm27029A2A4P4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm27029A2A4P4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm27029A2A4P4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm27029A2A4P4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm27029A2A4P4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm27029A2A4P4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm27029A2A4P4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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