Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm5538W4VSP6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms