Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Hdac5Q9Z2V6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Hdac5Q9Z2V6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Hdac5Q9Z2V6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac5Q9Z2V6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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