Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Vamp5Q9Z2P8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms