Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Crlf3Q9Z2L7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Crlf3Q9Z2L7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Crlf3Q9Z2L7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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