Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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