Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms