Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms