Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Gdf15Q9Z0J7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Gdf15Q9Z0J7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gdf15Q9Z0J7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms