Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn3Q9Z0G9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cldn3Q9Z0G9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn3Q9Z0G9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms