Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stxbp4Q9WV89 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stxbp4Q9WV89 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms