Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Psma1Q9R1P4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms