Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NrkQ9R0G8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms