Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nek3Q9R0A5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms