Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf10bQ9QZM4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms